问题描述：

医学研究者最近发现了某新病毒，通过对这些病毒的分析，得知他们的DNA序列都是环状的。现在研究者已收集了大量

的病毒DNA和人的DNA数据，想快速检测出这些人是否感染了相应的病毒。为了研究方便，研究者将人的DNA和病毒DNA

均表示成由一些字母组成的字符串序列，然后检测眸中病毒DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过，如果出现过，则

此人感染了该病毒，否则没有感染。例如，假设病毒的DNA序列为baa，患者1的DNA序列为aaabbba，则感染；患者2的

DNA序列为babbba，则未感染。（注意，恩德DNA序列式线性的，而病毒的DNA序列为环状的）。

Input：

abbab  abbabaab

baa      cacdvcabacsd

abc      def

0          0

Output：

YES

NO

NO

 

BF算法(即遍历法)：

1 #include "stdafx.h" 2 #include
     
       3 #include
      
        4 #include
       
         5 using namespace std; 6  7 int Index_BF(const string &str1, const string &str2, int pos) 8 { 9 10     int i = pos;11     int j = 0;12     int len1 = str1.size();13     int len2 = str2.size();14     while (i
        
         
          = len2)28         return i - len2;29     else30         return -1;31 }32 33 int main()34 {35     int pos = 0;36     string str1;37     string str2;38     while (cin >> str2 >> str1)39     {40         if (str1 == "0"&&str2 == "0")break;41         int result = Index_BF(str1, str2, pos);42         if (result != -1)43             cout << "YES" << endl;44         else45             cout << "NO" << endl;46     }47     return 0;48 }
         
        
       
      
     

 

KMP算法：

1 #include "stdafx.h" 2 #include
     
       3 #include
      
        4 #include
       
         5 #include
        
          6 using namespace std; 7  8 void get_next(string str2,int *next) 9 {10     int i,j;11     i=1;12     j=0;13     next[1]=0;14     while(i
         
          =len2)52             return i-len2;53         else54             return -1;55 }56 57 int main()58 {59     int pos=0    ;60     string str1;61     string str2;62     while(cin >>str2>>str1)63     {64         if(str1=="0"&&str2=="0")break;65     int result=kmp(str1,str2,pos);66     if(result!=-1)67         cout<<"YES"<
         
        
       
      
     

 

对于正常的字符串模式匹配，主串长度为m，子串为n，时间复杂度会到达O（m*n），而如果用KMP算法，复杂度将会减少线型时间O（m+n）。

 

设主串为ptr="ababaaababaa";，要比较的子串为a=“aab”；

 

KMP算法用到了next数组，然后利用next数组的值来提高匹配速度，我首先讲一下next数组怎么求，之后再讲匹配方式。

 

NEXT[]详解：

next数组详解

首先是理解KMP算法的第一个难关是next数组每个值的确定，这个问题困恼我很长时间，尤其是对照着代码一行一行分析，很容易把自己绕进去。

定义一串字符串

ptr = "ababaaababaa";

 

next[i]（i从1开始算）代表着，除去第i个数，在一个字符串里面从第一个数到第（i-1）字符串前缀与后缀最长重复的个数。

 

什么是前缀？

在“aba”中，前缀就是“ab”，除去最后一个字符的剩余字符串。

同理可以理解后缀。除去第一个字符的后面全部的字符串。

 

在“aba”中，前缀是“ab”，后缀是“ba”，那么两者最长的子串就是“a”；

在“ababa”中，前缀是“abab”，后缀是“baba”，二者最长重复子串是“aba”；

在“abcabcdabc”中，前缀是“abcabcdab”，后缀是“bcabcdabc”，二者最长重复的子串是“abc”；

 

这里有一点要注意，前缀必须要从头开始算，后缀要从最后一个数开始算，中间截一段相同字符串是不行的。

 

再回到next[i]的定义，对于字符串ptr = "ababaaababaa";

next[1] = -1,代表着除了第一个元素，之前前缀后缀最长的重复子串，这里是空 ,即""，没有，我们记为-1，代表空。（0代表1位相同，1代表两位相同，依次累加）。

next[2] = -1，即“a”，没有前缀与后缀，故最长重复的子串是空，值为-1；

next[3] = -1，即“ab”，前缀是“a”，后缀是“b”，最长重复的子串“”；

next[4] = 1，即"aba"，前缀是“ab”，后缀是“ba”，最长重复的子串“a”；next数组里面就是最长重复子串字符串的个数

next[5] = 2，即"abab"，前缀是“aba”，后缀是“bab”，最长重复的子串“ab”；

next[6] = 3，即"ababa"，前缀是“abab”，后缀是“baba”，最长重复的子串“aba”；

next[7] = 1，即"ababaa"，前缀是“ababa”，后缀是“babaa”，最长重复的子串“a”；

next[8] = 1，即"ababaaa"，前缀是“ababaa”，后缀是“babaaa”，最长重复的子串“a”；

next[9] = 2，即"ababaaab"，前缀是“ababaaa”，后缀是“babaaab”，最长重复的子串“ab”；

next[10] = 3，即"ababaaaba"，前缀是“ababaaab”，后缀是“babaaaba”，最长重复的子串“aba”；

next[11] = 4，即"ababaaabab"，前缀是“ababaaaba”，后缀是“babaaabab”，最长重复的子串“abab”；

next[12] = 5，即"ababaaababa"，前缀是“ababaaabab”，后缀是“babaaaababa”，最长重复的子串“ababa”；

 

还有另外一种方法，我看的有的书上写着：

这里我们定义next[1] = 0 , next[1] = 1;

 

再分析ptr字符串，ptr = "ababaaababaa";

跟上一个的情况类似，

 

next[1] = 0 ,事先定义好的

next[2] = 1 ,事先定义好的

next[3] = 1 ,最长重复的子串“”；1代表没有重复，2代表有一个字符重复。

next[4] = 2 ，最长重复的子串“a”；追偿的长度加1，即为2.

next[5] = 3 ，以下都跟之前的一样，这种方法是最长的长度再加上一就可以了。

next[6] = 4

next[7] = 2

next[8] = 2

next[9] = 3 

next[10] = 4 

next[11] = 5 

next[12] = 6 

 

以上是next数组的详细解释。next数组求值 是比较麻烦的，剩下的匹配方式就很简单了。

next数组用于子串身上，根据上面的原理，我们能够推出子串a=“aab”的next数组的值分别为0,1,2.（按照我说的第二种方式算的）。

 

首先开始计算主串与子串的字符，设置主串用i来表示，子串用j来表示，如果ptr[i]与a[i]相等，那么i与j就都加1：

prt[1]与a[1]相等，i++，j++：

用代码实现就是

 

1 if( j==0 ||  ptr[i]==a[j])  2 {  3     ++i;  4     ++j;  5 }

 

 

 

ptr[2]与a[2]不相等

此时ptr[2]!=a[2]，那么令j = next[j]，此时j=2，那么next[j] = next[2] = 1.那么此时j就等于1.这一段判断用代码解释的话就是：

 

1 if( ptr[i]!=a[j])  2 {  3       j = next[j];  4 }

 

加上上面的代码进行组合：

在对两个数组进行比对时，各自的i，j取值代码：

 

1 while( i
         

 

 

1           next[i] = j;  2     }  3     else  4     {  5           j = next[j];  6     }  7 }

 

此时将a[j]置于j此时所处的位置，即a[1]放到j=2处，因为在j=2时出现不匹配的情况。

 

此时再次计算是否匹配，可以看出来a[1]!=ptr[2],那么j = next[j]，即此时j = next[1] = 0;

根据上面的代码，当j=0时，执行++i；++j；

此时就变为：

此时ptr[3] = a[1],继续向下走，下一个又不相等了，然后“aab”向后挪一位，这里不再赘述了，主要的思想已经讲明白了。到最后一直到i = 8，j=3时匹配成功，KMP算法结束。整个过程就结束了。

测试结果：